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注解一般分几种。最常见的是脚注和尾注，就是你在文章某句话后面加个上标数字，然后在页脚或者文章最后面解释这个词什么意思，或者说明引用来源。还有一种是在作者名字后面打个星号，说明这位作者是通讯作者，或者标注下基金项目。这些都属于注解。

大部分常用的论文查重系统，比如知网、维普、万方这些，它们查重的时候，主要瞄准的是论文的正文主体部分。系统会有自己的一套算法，去识别哪些内容是文章的核心部分，哪些是辅助性的注解。通常情况下，系统会默认把这些脚注、尾注，还有作者信息、基金信息这些过滤掉，不把它们算进重复率里面。你可以这么理解，系统的设计目的是防止正文观点的抄袭，注解更多是格式性的、说明性的东西，所以一般不给算进去。

这里有很重要的“但是”。第一，系统的识别不一定百分之百准确。如果你的注解格式非常不规范，比如该用脚注的地方你没用正确的格式，就是随手写在括号里，系统可能就认不出来这是注解，会把它当成正文一起查了。第二，更关键的是，即使系统不查，看论文的人会看。特别是你注解里的内容，如果是大段大段从别的地方抄来的解释，或者你的引用标注本身就是错的，这虽然在查重报告上可能不标红，但评审老师一眼就能看出来，这问题更严重，是学术不规范。

对你来说，比较实际的做法是：首先，确保你用的注解格式是正确的、标准的。用Word或者专业软件插入正确的脚注尾注，别自己胡乱打字。这样系统识别和过滤的几率最大。其次，注解里的内容也要注意。如果是解释某个术语，尽量用自己的话简单概括一下。如果是引用来源，务必标注准确。你不能因为想着“反正注解不查重”，就在注解里大段复制百科解释，这是自己给自己挖坑。

最稳妥的办法，就是在你提交论文最终版之前，自己想办法查重一次。现在很多查重系统在出报告时，会有一个“全文对照”报告，里面会显示系统到底检测了哪些内容，把哪些内容排除在外了。你重点看看你的那些注解，在报告里出现了没有。如果没出现，那基本就说明系统把它当注解过滤了。如果出现了并且标红了，你就得回去检查是不是格式出了问题，或者里面确实有需要修改的重复内容。